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自強課程
課程名稱
【竹科管理局補助課程】生物資訊應用於蛋白質藥物開發實作
熱烈招生中
園區內超值優惠價！機會難得，敬請把握！
由清大副校長設計的優質好課！
課程代碼：
13B3326
上課時間：
2024/09/21(六)、09/22(日) / 9:00~16:00 共計12小時
上課時數：
12 小時
課程費用：
(以下費用已由竹科管理局補助80%)
1200元
(科學園區廠商優惠價格需送出報名表後，系統發出報名成功回函確認金額。)
超值優惠：
課程目標：
雖然新冠病毒的疫情已經解封，但實際上病毒的變異和流行仍在持續，此外，像流感、麻疹等傳染力很強的病毒性疾病也在流行。針對這些病毒蛋白的研究亦持續不斷，許多病毒蛋白的結構陸續被解出。本課程將從研究蛋白質結構的角度切入，探討病毒蛋白的實驗結果和應用。我們將使用結構視覺化和具象化的方式，讓學員了解病毒蛋白質與藥物的結合，並實際應用於相關的結構研究。這些研究方法同樣也適合想要了解如何應用結構生物資訊探討自己實驗標的蛋白質的研究者，可以藉由結構的層面切入與輔助解釋現有的實驗結果。本課程的主要內容著重於實際應用，我們希望透過簡明的學習概念和實作，提供從序列到結構的基礎研究方法。除了搭配3D結構視覺化軟體(PyMOL)實地操作，帶領學員快速了解蛋白質基礎結構特性外，我們還會介紹結構模擬(SWISS-MODEL+AlphaFold2)，並演練蛋白質-藥物分子的對接和虛擬篩選，以及蛋白質與化學分子或其他蛋白質之間的分子作用力分析。透過實際研究成果和經驗分享，我們將以實例讓學員快速了解結構生物資訊分析工具的功能和應用層面。同時，我們將通過實際操作解析蛋白質結構或進行單點突變結構模擬和預測，實際操作蛋白質結構視覺化軟體，輔助觀察蛋白質的結構、作用力和表面電位等基礎結構特性。隨後，我們將基於藥物設計概念，實際演練蛋白質與藥物分子對接(Molecular docking)和虛擬藥物篩選，以及蛋白質與蛋白質之間的對接。最後，我們將分析Docking complex (蛋白質-藥物或蛋白質-蛋白質)之間的交互作用力。
課程特色：
*使用本會電腦教室上課或請學員自行帶筆電(以開課通知為準)
本課程強調讓大家-回去也能實作，歡迎踴躍報名參加。
🔬 深入了解蛋白質結構與相互作用的基礎知識，有助於設計更有效的蛋白質藥物。
🔬 學習生物資訊工具和技術，提高藥物開發的效率和成功率。
🔬 掌握蛋白質結構分析和預測技術，有助於設計和優化蛋白質藥物的結構。
🔬 學習分子對接和虛擬篩選等技術，可以幫助廠商發現潛在的藥物候選物，並加速新藥的開發進程。
本課程強調讓大家-回去也能實作，歡迎踴躍報名參加。
🔬 深入了解蛋白質結構與相互作用的基礎知識，有助於設計更有效的蛋白質藥物。
🔬 學習生物資訊工具和技術，提高藥物開發的效率和成功率。
🔬 掌握蛋白質結構分析和預測技術，有助於設計和優化蛋白質藥物的結構。
🔬 學習分子對接和虛擬篩選等技術，可以幫助廠商發現潛在的藥物候選物，並加速新藥的開發進程。
課程大綱：
1.Introduction to protein data bank (PDB)
蛋白質結構資料庫(PDB)介紹
2.Protein Structure Visualization (PyMOL)(實作練習)
蛋白質結構視覺化軟體操作 (PyMOL)
3.Sequence to Structure- Homology Modeling and Prediction (實作練習)
蛋白質結構模擬與預測實作
4.Introduction to Molecular Docking & Case Study
分子對接簡介與實例介紹
5.Molecular Docking and Virtual Screening (實作練習)
蛋白質-藥物分子對接與虛擬篩選實作
6.Protein-protein Docking (實作練習)
蛋白質-蛋白質對接實作
7.Protein-ligand or Protein-protein Interaction (實作練習)
蛋白質與藥物分子或蛋白質間分子作用力分析
*深入了解蛋白質結構資料庫（PDB）：探索世界頂尖的蛋白質結構資料庫，學習如何從中獲取關鍵信息並進行分析。
*蛋白質結構視覺化軟體操作：透過實作練習，學會使用PyMOL等工具進行蛋白質結構的視覺化，深入理解蛋白質結構的三維空間結構。
蛋白質結構資料庫(PDB)介紹
2.Protein Structure Visualization (PyMOL)(實作練習)
蛋白質結構視覺化軟體操作 (PyMOL)
3.Sequence to Structure- Homology Modeling and Prediction (實作練習)
蛋白質結構模擬與預測實作
4.Introduction to Molecular Docking & Case Study
分子對接簡介與實例介紹
5.Molecular Docking and Virtual Screening (實作練習)
蛋白質-藥物分子對接與虛擬篩選實作
6.Protein-protein Docking (實作練習)
蛋白質-蛋白質對接實作
7.Protein-ligand or Protein-protein Interaction (實作練習)
蛋白質與藥物分子或蛋白質間分子作用力分析
*深入了解蛋白質結構資料庫（PDB）：探索世界頂尖的蛋白質結構資料庫，學習如何從中獲取關鍵信息並進行分析。
*蛋白質結構視覺化軟體操作：透過實作練習，學會使用PyMOL等工具進行蛋白質結構的視覺化，深入理解蛋白質結構的三維空間結構。
課程師資：
講師：呂平江 副校長
現職：國立清華大學生物資訊暨結構生物研究所 教授兼任副校長
專長：蛋白質體學、結構生物學、生物資訊
講師：劉益忠 博士
現職：國家衛生研究院群體健康研究所 博士後研究員
專長：生物資訊、結構生物學
現職：國立清華大學生物資訊暨結構生物研究所 教授兼任副校長
專長：蛋白質體學、結構生物學、生物資訊
講師：劉益忠 博士
現職：國家衛生研究院群體健康研究所 博士後研究員
專長：生物資訊、結構生物學
主辦單位:
國家科學及技術委員會新竹科學園區管理局
執行單位：
財團法人自強工業科學基金會
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學員須知：
注意事項
※請前往竹科管理局廠商與單位名錄進行查詢，即可判斷公司是否為園區內廠商。
- 本計畫鼓勵女性學員報名參加培訓課程，必要時得優先錄取。
- 本計畫以竹科園區事業單位從業員工為主優先錄取，若有名額將開放有志進入園區就業人士報名參加。
- 防疫期間如有居家隔離、居家檢疫、自主健康管理且有呼吸道感染症狀等情形者，務必遵守中央流行疫情指揮中心防疫措施，請勿出席。
- 若遇不可預測之突發因素，基金會保有相關課程調整、取消及講師之變動權。
- 無紙化環境，輕鬆達到減碳救地球，即日起16小時以上課程結業證書或未達16小時課程上課證明皆以電子方式提供。
- 本課程不適用廠商VIP折扣優惠
- 課前請詳閱簡章之課程內容或利用課程諮詢電話。
- 課程嚴禁旁聽，亦不可攜眷參與。
- 優惠方案擇一使用。
